和单位签就业协议，再没有本人当场同意的情况下在合同上另复有条款，这样的合同有法律效应吗，

就业协议为民事合同，不同于劳动合同，主要不同体现在适用的法律不同。作用为用人的双方定下用工的意向，一般的法律时效为签订时间至你到用人方报到达成实际的用工关系。
既然是三方那你就算一方，你作为一方要秉着独立自愿，他题你乱写明显违背了，跟他闹，其实他们就是欺负一些学生不懂合同法，希望你能争取你的权利！

这个肯定不需要交违约金啦，就业协议又不是劳动合同，就业协议通常叫三方协议，只是作为用人单位、毕业生和学校之间的一个协议，但跟劳动合同不是同一回事。而且没有经过签名的条款本来就没有法律效力吧。

就业协议不等于劳动合同
一、就业协议与劳动合同的区别
（一） 主体不同
就业协议适用于应届毕业生与用人单位、学校三方之间，学校是就业协议的鉴证方或签约方，就业协议对用人单位的性质没有规定，适用任何单位；而劳动合同只适用于劳动者（含应届毕业生）与用人单位（不含公务员单位和比照实行公务员制度的组织和社会团体以及军队系统）之间，与学校无关。
（二） 内容不同
毕业生就业协议的内容主要是毕业生如实介绍自身情况，并表示愿意到用人单位就业、用人单位表示愿意接受毕业生，学校同意推荐毕业生并列入就业方案，而不涉及毕业生到用人单位报到后，应享有的权利义务。劳动合同的内容涉及劳动报酬、劳动保护、工作内容、劳动纪律等方方面面，更为具体，劳动权利义务更为明确。
（三） 时间不同
一般来说就业协议签订在前，就业协议应在毕业生就业之前签订，而劳动合同往往在毕业生到用人单位报到后才签订。
（四） 目的不同
就业协议是毕业生和用人单位关于将来就业意向的初步约定，是对双方的基本条件以及即将签订的劳动合同的部分基本内容的大体认可，并经用人单位的上级主管部门和高校就业部门同意，一经毕业生、用人单位、高校、用人单位主管部门签字盖章，即具有一定的法律效力，是编制毕业生就业方案和将来双发订立劳动合同的依据。
（五） 适用法律不同
就业协议发生争议，除根据协议本身内容之外，主要依据现有的毕业生就业政策和法律对合同的一般规定来加以解决，尚没有专门的一部分法律对毕业生就业协议加以调整。而劳动合同发生争议，应依据《劳动法》来处理。

二 、签订就业协议的程序
1、 毕业生和用人单位达成协议并在就业协议书上签名盖章，用人单位应在协议书上注明可以接收毕业生档案的名称和地址。
2、用人单位进人，如须经主管部门同意则应报上级主管部门批准。（如当地的人事局、去上海、北京、深圳、广州则另有要求）
3、毕业生将签订好的协议书直接送到学院毕业生就业指导工作处。
4、学校会及时将协议书的审核情况反馈给用人单位和毕业生。
5、 对于考研、专升本的毕业生，在与用人单位签定协议时要说明情况，如用人单位在知情后同意签约，毕业生在录取研究生或升入本科后不承担违约责任。没有签约的考研、专升本的毕业生将就业协议书统一交到就业处。
6、在2005年5月20日前签完就业协议书的毕业生，将协议书及时交到就业处，确保在毕业时能及时拿到就业派遣证。

三、落实了就业单位，如何派遣？
（1）毕业生和用人单位签订"毕业生就业协议书"，到当地人事部门审核备案，并在审核备案表或就业协议书上盖章：此种情况毕业生的所有关系将直接派到毕业生工作单位。
（2）毕业生和用人单位签订"毕业生就业协议书"，当地人事部门不能审核备案：本人可在单位工作，但户口、档案可回原籍，也可挂在人才服务中心。
（3）毕业生和用人单位签订"毕业生就业协议书"，只是暂时没有到所在地政府毕业生就业工作部门审核备案：可先提供工作证明，作为学院了解毕业生就业去向和统计就业率。待审核备案手续办完后，再办派遣。

四、由于各种原因暂时不能签约，怎么办？
（1）由于各种原因暂时不能签约，必须提供工作证明，以作为学院了解毕业生就业去向和统计就业率所用，户口、档案暂时保留在学院。
（2）毕业生须将工作证明和“要求把户口、档案保留在学院的申请”在2005年5月20日前由系部收起统一交到学院毕业生就业指导办公室，这样，户口、档案方可保留在学院两年。

五、签订协议时应注意的问题
1、 查明用人单位的主体资格
签订就业协议的当事人必须具备合法的主体资格，一般而言用人单位必须具有从事各项经营或管理活动的能力，单位应有录用指标和录用自主权。
2、 按规定的程序签订协议
毕业生凭学校发放的就业协议书，在与用人单位签约后交学校就业指导工作处。
3、有关条款的内容必须明确
毕业生与用人单位在签约时，尽量采用示范条款。如确有必要进行变更或增加，亦应在内容上必须明确。
4、注意与劳动合同的衔接
由于毕业生就业协议签订在先，为避免在日后订立劳动合同时产生纠纷，应尽可能将劳动合同的主要内容体现在就业协议的约定条款中，并明确表示在今后订立劳动合同时应予以确认。
5、 对合同的解除条件做事先约定
毕业生就业协议一经订立，就对当事人具有约束力，不得随意解除，否则应承担违约责任。
六、 就业协议的解除
就业协议的解除分为单方解除和双方解除。
单方解除，包括单方擅自解除和单方依法或以协议解除。单方擅自解除属违约行为。单方依法或以协议解除，是指一方解除就业协议有法律上或协议上的依据，此类单方解除，解除方无须对另一方承担法律责任。
双方解除是指毕业生、用人单位，经协商一致，取消原订立的协议，使协议不发生法律效力。双方均不承担法律责任，但须征求学校同意。
七、 违约责任及毕业生违约的后果
毕业生违约，除本人应承担违约责任支付违约金外，往往还会造成其他不良的后果，主要表现在：
第一， 就用人单位而言，用人单位往往为录用一名毕业生作了大量的工作，一旦学生违约，会给用人单位造成被动。
第二， 就学校而言，用人单位往往将毕业生违约行为认为是学校的管理不严，从而影响学校和用人单位的长期合作关系。
第三， 就其他毕业生而言，违约会影响其他毕业生的就业，造成就业信息的浪费。

希望能够帮助到你！

合同当事人不在场的情况下签订的就业协议书不具有法律效力。当然，这违约金也不需要楼主支付的。且学校代签就业协议，学校也有相应责任妥善处理相关问题，所以楼主可以求助于学校帮忙解决与单位解约的相关事宜。
补充说明一下，就业协议书是专属于毕业生的一种特殊合同形式，若为正常签约，则也具有相应的法律效力的。
希望能解决你的问题，如有需要可再联系。祝顺利！