商务局通常为行政机构，不属于事业单位，所以商务局属于党政机构改革范畴，不参加事业单位改革。如果楼主实在不放心，可以查询您关注的商务局统一社会信用代码证号，“11”打头为机关类单位，“12”打头才是事业单位。
