石蕊分子中有一个特征基团，在不同pH值范围会显示出不同的颜色。实际是基团结构改变的结果。
石蕊是从多种地衣所制得的天然蓝色色素，属于黄酮类化合物中的花色素类衍生物，具有C6-C3-C6结构。商品石蕊呈蓝色粉末、块状或压制成正方形。它的主要化学成分是C9H10O5N和C13H22O6。市售石蕊含有许多填充剂，仅有4%~5%的有效成分，加酸溶液变红，加过量的碱溶液又重新变成蓝色，pH变色范围在5~8之间。
