有很多方法，可以下载软件也可以在线构建。在线构建可将你的序列输入PUBMED的Blastn中进行对比，结果中有一种就是系统发育树，但里面残余对比的序列太多，逆序挑选一下。软件有很多，比较简单的是DNAstar中的Megalin，但结果比较粗。推荐用ClustalX软件进行同源性比对后，运用MEGA3.0软件进行系统发育分析并绘制系统发育树，也很简单，看看说明就会。比较公认的严谨的是philip系列软件，但操作复杂。
