首先先解释何为临床型和科研型的研究生。
专业型研究生这个“称号”是来自于国家对硕士研究生教育制度的改革，出现的时间并不长。具体国务院的文件可以通过网络等方式获取，不过都是些概括性极强的方向性东西。总之，专业型研究生是为了适应目前经济发展需要而产生的，但具体操作方式上给各个硕士授予单位留有很大的余地，这也就造成了专业型硕士培养方式的混乱。
区别：
科研型研究生要做论文，答辩过了才能毕业。临床型只要写综述，不用答辩，
1、医学类的专业硕士均为双证（学位证+毕业证），不存在单证之说。
2、关于学术型和专业型孰好孰坏之说，不能一概而论。总之：（1）学术型考博容易（学术型博士），可以提前攻读博士、转博。（2）专业型好毕业（只需写一篇综述），不可以提前攻博、转博。但是可以直接考临床型博士。
3、学习：学术型的在学校学习一年，然后下临床轮转一年，最后一年做实验，出文章。（只限于国内一般的医学院，TOP10的医学院校基本上是不下临床的，因为导师的课题做不完）
专业型的在学校学半年，下面两年半的临床，本科室学习一年，二级学科方向轮转一年，最后半年出文章，进行答辩。但是这个也不是绝对的。
4、学费补贴：学术型的大部分是公费，一般可用享受到国家普通奖学金。临床型的基本都是自费，享受基本奖学金各个学校不一样。但是在临床上享受的补贴要比学术型的多。
5、科研：临床型的也可以做科研，主要在于个人意愿。理论上，临床型的必须做科研，至少做临床标本方向的。
6、最后颁发的学位证也是不一样的。
一般而言学术型的专业写到三级学科。如：内科学（心血管）。不包含研究方向。临床型的只写到二级学科。如：内科学。这样的好处是，首先可以增加就业方向，只要是在内科学的范畴内的都可以就业。缺点是可能专业不对口。