早期的推理漫画多以名著为脚本所画的推理漫画，原创的推理漫画非常少，总体市场也不火。
这个状况直到1992年开始在讲谈社旗下的《周刊少年Magazine》上连载连载的《金田一少年之事件簿》获得强烈的反响与巨大的成功后才改观。接着，做为竞争对手小学馆的为了能在这市场上分一杯羹，漫画《名侦探柯南》从1994年开始在《周刊少年Sunday》杂志上连载 。
在这2个作品的带动所引发的神秘推理热潮下，其它同类作品也陆续加入这个新市场竞争。如1995年的《傀儡师左近》、1996年的《心理搜查官草薙葵》、1997年的《名侦探21休》、1998年的《少年侦探Q》等。但大多都因人气不佳而草草停刊 。
近几年来，随着漫画与推理小说的盛行，两者结合的推理漫画也渐渐收到了人们更多的追捧与欢迎，不少青少年也将部分视线从推理小说转至推理漫画。很多新兴漫画作品也是根据推理小说改编而来，如GOSICK、冰菓、神的记事本等。
随着推理漫画越来越热潮，很多其他风格的作品也夹杂着推理元素。不少推理漫画以校园为舞台，更是获得了进一步的支持。
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