蛋白质分离器是利用气泡的表面张力来分离水中的蛋白质的，蛋白质分离器主要用于海水缸。海水与淡水成分不同，海水的密度比淡水大，所产生的气泡表面张力也有所不同，所以海水缸的蛋白质分离器用在淡水水族箱几乎是没什么效果的，对于淡水的过滤系统也没多大作用。
