根瘤细菌有很多种，常见的根瘤细菌大多专门侵染豆科植物的根，而且不同的根瘤细菌会选择不同的豆科植物作为伴侣。根瘤菌自身身体极小，宽只有0.5～0.9微米，身长不过1～3微米。它们的模样也不全相同，有的像根短棍，有的像个圆球。
