1、事实上的模糊性。从表面上看，渎职侵权案件事实具有一定的公开性，即危害结果往往表现为公开，但在判断是否涉嫌犯罪时，却往往模糊不清。表现在：一是要件事实不清，即符合犯罪构成条件的事实不明显。有实际损害结果事实不清的，有行为违背职务特征不清的，也有主体身份不明确的等等。二是案件性质不清，即案件事实是犯罪事实还是违规违纪事实不易判断。三是职责义务不清。违的是什么规，失的是什么职，越的是什么权，负的是什么责不明确。
2、情节上的复杂性。从渎职侵权罪案的类型看，以犯罪结果为犯罪成立条件的结果犯罪中，“多因一果”或“多果一因”的情况较为普遍，因果关系复杂;以行为完成为犯罪成立条件的行为犯中，决策、组织、指挥、实施环节较多，职权关系复杂;以情节严重为犯罪成立条件的情节犯中，动机、手段、后果表现不一，标准笼统，情况复杂。
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