截至2016年6月，东莞市地铁是不经过东莞市汽车客运总站的。距离东莞市汽车客运总站最近地铁线路为东莞市地铁2号线。东莞市地铁2号线与东莞市汽车客运总站较近的地铁站有：
1、鸿福路地铁站，距离东莞市汽车客运总站5公里左右。
2、西平地铁站，距离东莞市汽车客运总站5.3公里左右。
从鸿福路地铁站到东莞市汽车客运总站公交车路线如下。
公交线路：x7路，全程约8.2公里
1、从鸿福路步行约640米,到达第一国际北站
2、乘坐x7路,经过7站, 到达东莞市汽车总站
3、步行约640米,到达东莞市汽车客运总站
从西平地铁站到东莞市汽车客运总站公交车路线如下。
公交线路：601路，全程约7.5公里
1、从西平步行约1.1公里,到达石竹新花园站
2、乘坐601路,经过5站, 到达东莞市汽车总站
3、步行约660米,到达东莞市汽车客运总站
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