通过分析可知：A、一种培养基上能长出多种菌落如细菌菌落、霉菌菌落，A不正确；B、菌落是由一个细菌或真菌繁殖后形成的集合体，B正确；C、培养基上的一种菌落只能由一细菌形成，C不正确；D、真菌的菌落一般有颜色，如红色、褐色、绿色、黑色、黄色等，D不正确．故选：B．
