公司这份保密协议肯定是违法的。第一:劳动者离职,只要提前30天提出书面申请即可,用人单位无权规定提前60天,明显违反法律规定。第二:单位可以与员工协商保密及竞业禁止条款,两年内不从事同类工作是典型的竞业禁止条款,但合同同时应约定,单位要在两年内给员工经济补偿,因为不应该让员工离职后不工作,没饭吃。第三:保密费算在工资里的说法也是不符合规定的。因此,你可以与公司协商变更合同条款。