植物病原原核生物并不独立于原核生物之外,其命名原则、分类方法、分类单元和分类系统与原核生物相同。界、门、纲、目、科、属、种。
细菌属的特征:形态特征和培养性状、生理生化性状、遗传性状。
种(species)的概念:种是许多具有共同特征的菌系组成的群体,通常这些菌系与其它菌系有很大的区别。基因种——细菌分类学家,分类种——植物病理学家。
亚种(subspecies):指在种下类群中在培养特性、生理生化和遗传学等性状有一定的差异的群体。
菌系(strain):是由分离获得的纯培养物单个菌落繁衍的后代组成。
模式菌系(type strain):是种的命名菌系,由它以及和它相似的其它菌系组成种。由于细菌的种的概念包含人为的主观判断,因此,细菌种的表型和遗传特性上存在明显的多样性。目前认为根据遗传的相关性来定种更为客观。
致病变种(pathovar,pv.):在细菌种下以寄主范围和致病性为差异来划分的组群。
生化变种(biovar):是种内的菌株,按生理生化性状的差异来划分的组群,不考虑致病性等其他性状的异同。