最开始是在第76 柯南对怪盗基德。基德利用柯南对小兰的担心逃脱。
还有就是剧场版三《世纪末的魔术师》基德与柯南说过一句“我为什么要在这个时候，解救一个棘手的敌人”就能看出来，
在剧场8中，基德对柯南说“你的情人已经做好晚餐等你回去吃呢”可见已经知道了他的身份。
在剧场版10 侦探们的镇魂曲中 开头还是一段老台词，“我是高中生侦探工藤新一……”介绍时最后说了一句，”知道我身份的人还有怪盗基德“。
而且剧场版8的时候，基德让柯南开飞机。也就是说他其实知道柯南是新一
没有具体的点明，但是剧场版里第三集，柯南与基德的对话中有透露出基德明白柯南身份的话。我也是柯迷哦
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