为什么tac克隆后dna比较纯
对于多个分子生物学和基因组学应用,从克隆和PCR到基因组测序和芯片分析,DNA纯化都是必经之路。然而,选择最佳的纯化试剂盒却并非易事。例如,在您纯化基因组DNA时,您需要一个试剂盒,能温和地处理核酸,同时又不分离质粒DNA。而且,新一代测序技术对样品的要求颇高,我们也需要一些专门的产品来纯化DNA。在此,我们介绍一些新选择。
盐沉淀方法
Epicentre(Illumina旗下公司)的MasterPure™ Complete DNA Purification Kit采用一种专利的盐沉淀方法。这一系列试剂盒覆盖各种样品类型,包括血液、固定组织、植物、酵母、昆虫等,在短短30分钟内可带来高产量的核酸,而损失极少。
据Epicentre的资深产品经理Cristine Kinross介绍,有了这些试剂盒,用户在测序或其他分子生物学应用的样品制备之前无需再进行额外的纯化。它们可去除蛋白及其他细胞碎片,而不引入那些必须去除的毒性化合物,从而避免了多次洗涤,并改善核酸产量。
Kinross谈道:“利用MasterPure回收核酸的出色纯度让样品可直接进入测序文库的制备。”当然,对于其他应用,包括芯片、qPCR和克隆,它也是适合的。此外,这个试剂盒也能用于RNA的纯化。在获得总的核酸后,经过DNase处理,就能得到总RNA。
多种试剂盒
Promega提供广泛的核酸纯化试剂盒,采用几种不同的策略。例如,Wizard® Genomic DNA Purification Kit是基于经典的沉淀法,可从全血、组织培养细胞、动物及植物组织、酵母和细菌中提取基因组DNA,灵活高效;而ReliaPrep™ 系列试剂盒采用柱提法,简单快速。此外,Promega还提供基于磁珠纯化的试剂盒。
Promega公司基因组学的全球产品经理Eric Vincent表示:“尽管溶液的确切组分会有不同,但裂解、结合、洗涤和洗脱的基本过程适用于不同的结合方法(如硅胶或纤维素),不同的纯化形式(纯化柱或磁珠),以及手动和自动纯化操作。”对于一些非常重要的样品类型(如FFPE样品),还需要一些专门的操作或处理。
“我们开发了独特的结合/洗涤缓冲液,它们能有效去除抑制下游反应的物质,而优化的系统让研究人员能够捕获少量的核酸并以小体积(不到30 μl )洗脱,我们还开发出自动化的解决方案,适合各种试剂和通量,”Vincent说。
这些试剂盒提供了完整的解决方案,能够以极小的体积洗脱核酸,同时又避免抑制剂残留在洗脱液中。经过这些试剂盒纯化后,核酸可用于PCR、Sanger测序、新一代测序、芯片等下游分析。