A、如果是体细胞发生基因突变，一般不会遗传给后代，如果是性原细胞发生基因突变，一般会遗传给后代，A错误；B、染色体变异产生的后代如果在减数分裂过程中能产生正常的配子，则可育，B错误；C、基因碱基序列发生改变，可能发生在非编码区或编码区的内含子中或改变后转录形成的密码子对应的是同一种氨基酸，所以不一定会导致性状改变，C正确；D、基因重组主要发生在生殖细胞形成过程中，基因工程也是利用基因重组的原理，D错误．故选：C．
