癸卯学制是主要参考日本的学制而制定的。清末民初,学制虽几经变更,但大都以此为基础,只略有损益。这一学制的颁布对中国近代科学的发展有极其重大的影响,从此,科学不再仅仅是少数热心者的爱好,而成为国家的事业,中国科学逐渐走上了体制化的道路。