两个学校都属于985/211工程院校，上海交大选“珠峰计划”、“111计划”、“2011计划”、“卓越医生教育培养计划”、“卓越法律人才教育培养计划”、“卓越工程师教育培养计划”、“卓越农林人才教育培养计划”。上海属于综合性类型，中科大属于理工型。
上海交大优势学科更全面，而中科大理科和计算机较好。
