今年3月1日起，不动产登记暂行条例施行，林地承包经营权和耕地的承包经营权都属于土地承包经营权。同一土地只能登记发证一次，不能重复登记发证。你的情况很特殊，又遇到现在特殊时期，要等不动产登记整合完成，那时林业和农业都归到不动产登记一个地方办理，应该可以解决了。
