荆芥、芥穗功能相似，常相互代用。1)荆芥是全草，它味辛、微温，药性比较平和，归属肺和肝经。善治风邪症，是发表散风之常用药。它具有发表散风，透疹疗疮又有止痛解痛之功效，适用风寒症或风热表证、麻疹不透、头风头痛、风疹瘙痒以及疮疡初起又挟有表证的人。2)荆芥穗的药效与荆芥基本相同，只是它的发汗力比荆芥大，药力也较强，也适用于荆芥所治的病症，但如果根据病情需要加强药力的话就用它代替荆芥。
