红海地处干热的沙漠地区，海面上经常空气闷热，尘埃弥漫。全年降水一般在一二百毫米之内，周围也很少有河流注入，而蒸发却十分旺盛，年蒸发量达2000毫米，远远超过年降水量。红海通过苏伊士运河与地中海之间的海水交换很微弱，补充红海海水的惟一通道是曼德海峡。夏季，表层海水由红海流入印度洋，底层则由印度洋流入红海；冬季的情况恰好相反。只是由于印度洋进入红海的水量大于红海进入印度洋的水量，才使得红海不至于因强烈的蒸发而逐渐干涸。不过，曼德海峡很狭窄，其下部还有一道高高的岩岭，这大大限制了流入红海的水量。以上都是致使红海温度、盐度高的原因。红海8月份表层海水温度可达27～32摄氏度，就是在200米以下的海水水温也有21摄氏度上下。含盐度一般都在40%以上，北部苏伊士湾一带高达43%。
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