1.降解水体中的亚硝酸盐、硫化物等有毒物质，净化水质
2.光合菌所含的酶类，可以促进鱼类对饲料的消化吸收，提高饲料利用率，降低饵料系数，同时还可显著提高鱼的生长速度
3.前期光合菌施入水体后，迅速繁殖成为水体中的优势细菌种群，既改善了水质，又抑制了有害病菌的生长和繁殖，降低了有害病菌数量，从而减少了鱼类病害的发生
4.水体中施入光合菌后，硅藻、小球藻等鱼类喜欢摄食的藻类成为优势藻类，而蓝藻等有害藻类受到抑制。光合菌能大量利用水中的氨氮，能有效避免“水华”的产生，如蓝藻的大量繁生。
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