广义相对论和量子论的冲突到底在哪，为什么难以调和

当然是有冲突的，而且至少现在这两者是难以调和的。不论狭义相对论还是广义相对论，都和量子力学有冲突，主要体现在两方面：1 决定论 2 定域性。广义相对论和牛顿力学一样，只要给定宇宙任意时刻所有物质的态，则宇宙此后的演化就决定下来了；而量子力学的几率假说则不是决定论的。2 相对论里规定了了一个速度上限光速，信息传播速度不能超过光速，而量子力学的波函数理论上是弥散到全宇宙的，宇宙中任意两点在某一给定时刻都会有关联。而Bell不等式被证否表明（一般认为，也有争议），决定论和定域性是不可能同时都对的。
另外，广义相对论是处理引力的理论，而引力在量子力学和量子场论的框架下一般认为是不能量子化的，虽然有圈量子化等一些学派，但是现在看上去比较有希望量子化引力的只有超弦-M理论，而该理论现在离能提出被检验的实验的阶段还早得很。
量子力学和量子场论都是建立在欧几里德空间或闵可夫斯基时空下的，时空不仅是连续的还是平直的，至于为什么不是弯曲时空，这正是引力量子化的困难。不确定性与时空的不连续性毫无关系。

广义相对论和量子论，二者没有任何冲突，也并非“难以调和”。

你说的“难以调和”，恐怕是对一场学术争论的误解，即，广义相对论的创立者爱因斯坦，与量子论的创立者波尔（及其支持者）之间的一场学术争论，这个学术争论是有关物理学深层的问题，并非“广义相对论”与“量子论”之间有什么“冲突”，或“难以调和”。

量子力学认为时空在很小的尺度上不连续（因此有不确定性，时间与空间失去意义），而广义相对论认为时空是一个四维连续体（它建立在时空背景上，会弯曲，但不会撕裂）。这是本质上的不同，因此有冲突。

相对论成立的条件是连续时空；而量子力学成立的条件是量子时空。