学院采取多元化可持续发展战略，大力开发北医系统一流丰富的医学教育资源，2004年开始涉足前景广阔的非学历教育，自主开发了“北京大学医学远程教育信息系统”（Medical Education Information System），即MEIS项目，利用宽带数字卫星结合高速网络传输的播放形式，专家库资源包括20多家医院220位专家学者，采取讲座、病例讨论、查房、手术演示等多种节目形式，内容涵盖临床医学各个专业，为全国医疗单位提供长期、正规、系统的医学培训服务，深受医务人员的欢迎。学院已与全国上百家医疗单位建立合作关系，受益医务人员达10万人。学院还积极开发研究生教育、全科医生岗位培训、远程教育质量管理等继续教育项目。
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