上海市第五人民医院创建于1904年，为工部局所建的“西人隔离医院”。1939年由日本同仁会接办，改称“同仁会医院”。1945年收归国有，定名为“上海市市立第五医院”，1949年上海解放，更名为“上海市市立第五人民医院”。1960年迁至闵行，一度又称“上海市闵行区中心医院”、“上海市工农医院”，1984年经批准恢复“上海市第五人民医院”院名。1995年原闵行区传染病医院并入。1998年闵行区人民政府和原上海医科大学联手共建市五医院，随着原上海医科大学与复旦大学合并为新的复旦大学，现医院又称“复旦大学附属上海市第五人民医院”。
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