根据植物学的基本原理,嫁接的接穗的特性会受到砧木的影响。例如米叶罗汉松嫁接到大叶罗汉松上,叶片易于变大;苹果嫁接到梨树上,结的果实就有些像梨,砧木越老就越是这样。这是嫁接的盆景树桩不如原本的受欢迎的主要原因。接穗和砧木如果亲和性不够或生长速度不一致还会造成有明显的疤痕,粗细不一致,易于从接口处断开等问题。所以追求美观的盆景树尽量不采用嫁接,获奖的盆景嫁接的也少见。当然在某些情况下,嫁接还是有优点的,例如某些嫁接的树种对环境适应性更强,生长更快,比原本的寿命更长等。因此也不应完全排斥嫁接,应当因树种而异。