就个人意见来看能胜诉。违章建筑按理应该拆除，既然没有政府应该是将其没收，转化为国有资产，然后再卖给你母亲，颁发房屋产权证，这是将违法的建筑合法化的过程，有一点打法律擦边球的感觉，但是现实中很多政府都存在这样的情形，所以你得找更多合法性的证据来证明你房屋取得来源的合法。
如果有与政府部门签订的房产转让协议或者其他类似文件，说明你母亲已经取得房屋的所有权，虽然是违章建筑，但是政府出让行为已经视为认定了建筑的合法性，因此，你舅舅不再享有所有权；
从公平的角度，你母亲可以给你舅舅一定的补偿，作为他建筑房产的弥补；
现在在诉讼中，你关键的举证问题：1）政府确认你舅舅违建的材料（课设拟请法院调取）；2）政府将房产转让给你母亲的证据；
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