【Meta】16s rRNA和16s rDNA的区别

一、指代不同
1、16srRNA：是细菌上编码rRNA相对应的DNA序列，存在于所有细菌的基因组中。
2、16srDNA：为核糖体的RNA的一个亚基，16SrDNA就是编码该亚基的基因。
二、功能不同
1、16srRNA：对于核糖体蛋白的固定起到脚手架的作用。3'末端包含反向的SD序列，用来与mRNA的AUG起始密码子结合。16SrRNA的3'端与S1、S21的结合被发现与蛋白质合成的开始有关系。与23S进行交互，帮助两个核糖体子单元的结合。
2、16srDNA：有多个区段保守性，根据这些保守区可以设计出细菌通用物，可以扩增出所有细菌的16SrDNA片段，并且这些引物仅对细菌是特异性的，也就是说这些引物不会与非细菌的DNA互补，而细菌的16SrDNA可变区的差异可以用来区分不同的菌。
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三、特性不同
1、16srRNA：16SrRNA具有高度的保守性和特异性以及该基因序列足够长（包含约50个功能域）。随着PCR技术的出现及核酸研究技术的不断完善，16SrRNA基因检测技术已成为病原菌检测和鉴定的一种强有力工具。
2、16srDNA：16SrDNA是细菌的系统分类研究中最有用的和最常用的分子钟，其种类少，含量大（约占细菌DNA含量的80%），分子大小适中，存在于所有的生物中，其进化具有良好的时钟性质，在结构与功能上具有高度的保守性，素有“细菌化石”之称
参考资料来源：/baike.baidu.com/item/16SrDNA/4082910#3"target="_blank"title="百度百科-16SrDNA">百度百科-16SrDNA
参考资料来源：/baike.baidu.com/item/16s%20rRNA/8122195?fr=aladdin"target="_blank"title="百度百科-16srRNA">百度百科-16srRNA

在文章或宣传稿中经常看到两者滥用，实际上是不同的。

首先是各个字母的含义：

16S中的"S"是一个沉降系数，亦即反映生物大分子在离心场中向下沉降速度的一个指标，值越高，说明分子越大。

rDNA 和rRNA中的小写字母"r"是ribosome(核糖体)的缩写。

rDNA指的是基因组中编码核糖体RNA（rRNA）分子的对应的 DNA序列 ，也就是编码16S rRNA的基因。

rRNA指的是 rDNA的转录产物 ，它是构成核糖体的重要成分，核糖体由许多小的rRNA分子组装而成，16S rRNA是其中一个组件。

一般所分析的对象都是16s rDNA ，因为DNA提取容易，也比较稳定。