柑橘炭疽病病菌为盘长孢状刺盘孢，属半知菌亚门刺盘孢属真菌。分生孢子盘直径为170～220μm，周围生深褐色1～2横隔膜的刚毛。分生孢子梗栅状排列，无色，圆柱形，着生长圆形分生孢子，无色，单胞，大小8.4～16.8μm×3.5～4.2μm。
