员工在个人所得税app上申报了专项扣除，我们人事是不是直接做工资的时候扣就行了，还是要去税务局申报啊

单位直接扣除即可。

依据《中华人民共和国税收征收管理法》第二十五条　纳税人必须依照法律、行政法规规定或者税务机关依照法律、行政法规的规定确定的申报期限、申报内容如实办理纳税申报，报送纳税申报表、财务会计报表以及税务机关根据实际需要要求纳税人报送的其他纳税资料。

扣缴义务人必须依照法律、行政法规规定或者税务机关依照法律、行政法规的规定确定的申报期限、申报内容如实报送代扣代缴、代收代缴税款报告表以及税务机关根据实际需要要求扣缴义务人报送的其他有关资料。

扩展资料：

个人所得税扣除的相关要求规定：

1、任何单位和个人都有权检举违反税收法律、行政法规的行为。收到检举的机关和负责查处的机关应当为检举人保密。税务机关应当按照规定对检举人给予奖励。

2、从事生产、经营的纳税人，税务登记内容发生变化的，自工商行政管理机关办理变更登记之日起三十日内或者在向工商行政管理机关申请办理注销登记之前，持有关证件向税务机关申报办理变更或者注销税务登记。

3、从事生产、经营的纳税人应当按照国家有关规定，持税务登记证件，在银行或者其他金融机构开立基本存款帐户和其他存款帐户，并将其全部帐号向税务机关报告。

参考资料来源：百度百科-中华人民共和国税收征收管理法

人事是不是直接做工资的时候扣就行，单位财务会代扣代缴。
个人在专项扣除有变动的时候，比如继续教育取得证书的当月还要报。
个人每年12月的时候要进行下一年专项扣除的确认。
其他的都不用管了。

直接扣就行