A、原核细胞中没有线粒体,也可以进行有氧呼吸,也能产生ATP,A正确;B、在光照条件下,光反应产生ATP,暗反应有ATP的分解,B正确;C、在有氧与无氧的条件下,细胞质基质都能形成ATP,C正确;D、ATP中的“A”指腺苷,DNA、RNA中的碱基“A”指腺嘌呤,不是同一种物质,D错误.故选:D.