酶工程指的是将生物酶的特殊告薯脊的催化性能应用到工业催化上去，如利用果糖转化酶将袜渗葡萄糖转化为果糖。蛋白质工程指的是将天然蛋白质结构进行改造，即对蛋白质进行改性，得到满足人类需求的具有新手含型特殊功能的蛋白质。如对天然丝、皮革的加工等等。
酶工程是研究酶的生产应用的技术性学科。酶的成分主要是蛋白质，也有RNA的。蛋白质工程当然是研究蛋白质散信祥理化性质和生产冲搏应坦洞用的。所以说酶工程和蛋白质工程师交叉学科。
