在综合实力上，内蒙古科技大学要强于内蒙古工业大学；但两校各有特色。内蒙古科技大学在冶金、稀土、矿业、土木、自动化、软件工程、生物科学、冶金机械等学科实力很强，和自治区经济结构结合的比较紧密。内蒙古工业大学在电气工程、化工、建筑学、机械工程学科实力也不弱。内工大的影响仅限于内蒙古自治区，而内科大在区外影响很大，近十年进步更快。
