近亲结婚不是孩子必有残疾。如果家族的基因中有缺陷，那么近亲结婚孩子被遗传到的可能就大。但是也有可能基因是正常的没有缺陷，或者只有色盲、秃顶这种小缺陷。
近亲婚配的夫妇有可能从他们共同祖先那里获得同一基因，并将之传递给子女，如果这一基因按常染色体隐形遗传方式，其子女就可能因为是突变纯合子而发病。我国婚姻法规定三代以内血亲禁止结婚，要超过五代结婚比较好，四代近亲结婚风险都是比较大的。
