公司股东的股权以工商登记确认。公司股东之间的股权可以在股东内部自由转让，并签订股权转让协议，转让公司股东以外的自然人或法人公司股东有优先购买权，因此只要是按上述要求转让达成股权转让协议就是合法有效的，协议生效后公司应及时修改章程或补充股权变更备案，并到工商部门变更登记。不管公司章程有没有修改，股东之间的股权转让法理上有效，符合公司法的相关规定。
如果是增股、扩股、重组变更只要经全体股东大会通过达成决议，不管有没有写入章程就在法理上有效，公司章程应按股东大会决议及时修改并通过。
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