未满16周岁没有身份证也是可以办理港澳通行证的，需要带上户口簿原件进行办理。以广东办理港澳通行证为例子：
1、首次申请往来港澳通行证和签注，申请人本人到当地公安分局出入境办证大厅递交申请，不能委托代办。
2、提交填写完整的《内地居民往来港澳地区申请表》1份（用钢笔或签字笔填写，不能使用圆珠笔），提交大一寸（48mmX33mm）背景为蓝色的正面免冠光学光面彩色照片1张。(如首次申办或换发往来港澳通行证，须提交广东省出入境证件数码相片检测回执)
3、交验身份证、户口簿原件（申请人未满16周岁，只需交验户口簿；军人只需交验身份证明），并提交复印件。
小孩子没有身份证是可以办理港澳通行证的，办理的程序和大人的是一样。
小孩子办理港澳通行证的时候，需要拿户口本的原件及复印件和父母任意一方的身份证原件及复印件，由父或母亲带着去办理。
办理流程
1、 获取并填写表格：《中国公民出入境证件申请表》。
2、 提交材料进行受理审核。
3、采集或核验指纹。
4、 受理、缴费：
(1) 审核不合格的由受理民警告知不予批准的原因，并出具不予批准通知书。
(2) 受理合格的获得《因私出境证件申请回执》，并完成缴费手续。
5、领取《往来港澳通行证》:凭《因私出境证件申请回执》在预约取证时间领取证件。
一、办理时限
1、申请往来港澳通行证的，受理之日起10个工作日内签发(不含证件由制证机关寄送至各受理机关的时间);
2、再次申请签注，在出入境接待中心申请的2个工作日后签发，在区(市)县公安出入境接待大厅申请的3个工作日后签发。
二、办理费用
往来港澳通行证100元/证;
一次有效签注20元/件;
二次有效签注40元/件。
参加旅游团赴香港或者澳门旅游的，申请“团队旅游”签注，并提交下列材料：
1.中国公民出入境证件申请表
2.往来港澳通行证
开放赴港澳个人旅游城市的居民赴香港或者澳门旅游，申请“个人旅游”签注，并提交下列材料：
1.中国公民出入境证件申请表
2.往来港澳通行证
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