可以考虑以费用开支来做,对应科目是其它应收款-XX客户.这样如果如果其它应付款科目有余额,就代表着有费用未收回.收回时再用其它收入进行冲销,对应科目同上.这样就不会走入主营业务收入中了.但也有缺点.就是进销存中无法查到运费收回情况,只能在财务报表中查询.
软件没有直接的处理办法无论怎么操作都会有弊端.