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中国科学院城市环境研究所是中国科学院与厦门市共建的资源环境与高技术交叉领域的正在建设中的研究所，是中国科学院下属的事业法人单位。研究所位于美丽的南方海滨城市 — 厦门市。
一、研究所名称
中文全称：中国科学院城市环境研究所
中文简称：城市环境所
英文全称：Institute of Urban Environment，Chinese Academy of Sciences
英文简称：IUE，CAS
二、城市环境所的使命与主要任务
1. 城市环境所的使命
坚持知识创新、技术创新与区域创新相结合，坚持科技创新与创新创业人才培育相结合，坚持院地共建与国际合作相结合，坚持和院内有关研究所协同与自主发展相结合，为我国城市和城市群的生态规划与建设、环境质量的改善提高、社会经济的可持续发展不断做出科技创新贡献，为人类未来城市文明建设提供理论依据和实践指南。
2. 城市环境所的主要任务
(1) 面向国家城市化发展过程中的生态环境保护等重大战略需求，面向国际城市生态科学和环境科学与技术的发展前沿，在城市生态、环境与健康，城市环境治理与修复技术，环境治理工程与循环经济，城市规划与环境政策等领域，开展理论研究、技术研发、系统集成和工程示范。
(2) 建立符合科技创新规律的现代研究所制度，建立有利于知识转移与技术转化的管理机制，建立与区域创新体系各单元联合合作的有效方式，建立面向城市生态与环境科技发展的公共技术研发平台，成为区域创新体系的有机组成部分，提升区域自主创新能力，带动区域相关产业发展，培育新兴产业。
(3) 结合重大科技任务引进优秀人才，结合科技创新实践培养学术人才，结合知识转移与技术转化向社会输送技术人才，结合区域经济社会发展需求培训管理人才，成为城市生态与环境研究领域人才高地，成为区域创新创业人才培养高地。
三、城市环境所重点领域
1.城市生态健康与环境安全
(1)城市生态健康系统分析与监测
(2)城市环境复合污染机理与效应
(3)城市环境安全风险评价与预警
(4)城市环境分析技术与方法
2.城市环境污染控制与资源化技术
(1)城市水污染控制与资源化技术
(2)城市大气污染控制与资源化技术
(3)城市固体废弃物污染控制与资源化技术
(4)高效环境材料制备技术
3.城市环境工程与循环经济
(1)城市环境污染控制工程与示范
(2)生态产业工程与示范
(3)城市生态环境技术集成与示范
(4)城市循环经济建设模式示范
4.城市生态环境规划与管理
(1)城市环境与全球变化
(2)城市发展与城市安全
(3)城市环境地空技术与数字城市
(4)城市生态环境规划理论与技术
(5)数字环境学（Digital Environmentology）的理论与应用
(6)城市环境管理与政策
四、城市环境所发展目标
1. 到2010年的发展目标
建成布局合理、设施一流、配套完善、环境优美的现代化科研园区。建立职责明晰、评价科学、开放有序、管理规范的现代研究所制度，形成有效推进科技成果转化与规模产业化的机制，以资产、人才、技术为纽带，实现所属各类研发单元的有机结合。形成以城市生态、环境与健康，城市环境治理技术，环境治理工程与循环经济，城市生态规划与环境管理研究为主线的科技布局，建立若干技术与工程示范基地，完成若干项综合技术示范。
2. 到2020年的发展目标
拥有一支结构合理、创新能力卓越的研发队伍，拥有以在学研究生与项目聘用人员为主体的高水平流动人员队伍，运行管理体系先进高效，产生的基础性战略性研究成果得到国际同行的广泛认同，产生的先进技术及科技成果被广泛接受与应用，培养的专门人才得到社会广泛认同与欢迎，成为紧密围绕国家与区域发展战略需求、在国际同领域有相当影响、基础研究前沿探索与应用技术研发并举的世界级研究机构。
五、人员规模
城市环境所人员总数量为760人，其中固定人员150人，流动人员260人，研究生300人，博士后、客座人员及访问学者50名。
六、所训
中国科学院城市环境研究所所训：忠诚、尽责。所训内涵为：
1. 忠诚
所训里的“忠诚”有以下几层含义：
对祖国的忠诚；
对人民的忠诚；
对事业的忠诚；
对研究所的忠诚；
对合作者的真诚；
对同事的真诚。
2. 尽责
所训中的“尽责”有以下几层含义：
尽责是“忠诚”对研究所每个成员的具体要求；
尽责是研究所每个成员“忠诚”的具体体现；
尽责寓意研究所全体及每个成员在创新理念的指导下，勤奋工作，不断取得创新成果。

厦门城市环境研究所将重点研究城市生态、环境与健康等领域，实行理事会制，中科院、厦门市分别投入建设经费1亿和2亿元人民币，该所占地两百余亩、建筑面积逾6万平方米，力争2008年底建成运行。