南京大学，武汉大学相对另外两所大学来讲好一点，而南开大学又比四川大学好。当然如果你能够做到看重专业而不注重大学整体名气，我给你的答案是每个大学都有比较强的专业，去各个大学官方网站就可以了解到。
看楼主想读什么专业的
四所大学各有所长
南大的理科是极强的，每年的专业论文发表量也是全国前列，总体在近几年排名中好于后三所
武大的社会人文在这四所是最好的，同时理科中的生物，工科的测绘遥感水利之类的，在全国范围内都罕有匹敌。
南开是一所历史名校，不过好像最近几年不怎么火，他的数学，金融，每年的分都十分高，是其强势专业。
四川大学医学不错，比较偏重于理工科，其他的不大清楚。
最近高校排名又出来了，楼主可以自己去查下
南京大学是最好的，南开和武大也不错，川大名声不如其他几所响，但是在一些专业和区位上还是有优势的
南京大学最好，其次是武大，在其次是南开，最后是川大 而且这四个学校的实力和各自城市发展情况也是一样的 根据自己能力依次挑选
都好，具体专业有高低，南京，南开一流，四川，武汉二流，具体你要看专业
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