您好，收集的数据类型主要有寄生虫相关的转录组数据,对这些数据进行了详细的归纳总结。 基于这些基础数据,从三个方面出发,进行生物信息学上的分析。具体来说,首先,基于秀丽线虫现有的蛋白蛋白相互作用数据,预测了日本血吸虫和曼氏血吸虫的蛋白相互作用网络,为寄生虫数据库的使用者对蛋白蛋白相互作用的研究带来了便利。其次,预测了微小隐孢子虫、恶性疟原虫、日本血吸虫和曼氏血吸虫四个物种的受体(包括G蛋白偶联的受体、核受体、阮病毒蛋白、钾离子通道),完成了数据库受体预测这一块的工作。最后,对日本血吸虫和曼氏血吸虫的血红蛋白降解途径进行分析,从序列和结构两个角度来分析血吸虫的血红蛋白降解情况。这部分的研究相对独立,依据疟原虫的血红蛋白降解途径为基础,预测出血吸虫的血红蛋白降解途径,并对降解途径上的关键酶的保守结构域和底物结构进行预测,研究酶与底物在三维结构上的相互作用关系。
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