购房合同是格式合同，购房者与开发商签订合同前一定要把需要约定的写在里边 ，要写清楚，为日后维权作足功课，买房不是向买菜，上当了也无所谓，买房几乎倾尽了一生的积蓄，买房前特别是签合同时还是应该请律师帮助为好。没写违约金的支付方式和期限对开发商有利，一但开发商违约他们支付违约金形式五花八门，有的用交供暖费、物业费、停车费等方式支付，现在应该与开发商签一份补充协议，主要针对支付违约金方式和期限。集体找更好。
已付款是指已经缴纳的购房款，不是首付款，银行已支付的也要算到里面。你们已经做了异议登记吧，如果做了，收房应该没问题。
个人观点：
1、已付房款包括首期款和按揭款（即房产全款，银行贷款也是你的钱）；
2、违约金的计算办法为头30天，每天10元，以后每月按已付款的0.1%来赔付。（以后每月－－约束模糊，不够一个月的话那要怎么算？）
3、不能以开发商口头的承诺或通知，要出书面的协议或合同；
4、赔付违约金和支付期限也要写进书面的协议或合同
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