赤潮的发生是多种因素综合作用的结果。首先，要有赤潮生物存在，这是赤潮发生的最基本的原因。它可以是所在海区原来就有的赤潮生物细胞和底栖休眠孢囊，也可以是其他海区迁移或扩散过来的。此外，在海水中还要有适量的营养盐，主要是氮和磷、微量元素(如铁和锰)，以及某些特殊有机物(如某些维生素和蛋白质)，它们的存在形式和浓度也直接影响着赤潮生物的生长、繁殖和代谢。这些是赤潮形成和发展的物质基础。同时，要求海水比较稳定，水体流动缓慢，加上适宜的水温和盐度，这样产生赤潮的条件就具备了。
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